RNAi干扰靶标验证实验(shRNA)
实验介绍shRNA是short hairpin RNA 的缩写,包括两个短反向重复序列。将shRNA序列构建进shRNA干扰载体中,并将构建好的质粒转染进细胞中,经RNA聚合酶合成相应的shRNA。shRNA经Dicer酶消化后形成双链siRNA,siRNA在细胞内RNA解旋酶的作用下解链成正义链和反义链,继之由反义siRNA再与体内一些酶结合形成RNA诱导的沉默复合物(RNA-induced silencing complex,RISC)。RISC与mRNA的同源区进行特异性结合,RISC具有核酸酶的功能,在结合部位切割mRNA,切割位点即是与siRNA中反义链互补结合的两端。被切割后的断裂mRNA随即降解,从而诱发宿主细胞针对这些mRNA的降解反应。
服务项目
服务流程1、目的细胞待沉默基因表达量检测
2、干扰序列设计
3、根据序列构建三个shRNA干扰质粒,并做无内毒素质粒中提
4、如果在非工具细胞中检测,则需要进行转染预实验
5、shRNA转染
6、24小时后,qPCR检测目的基因表达情况,筛选合适的shRNA干扰质粒
最终提供 详细实验报告、shRNA干扰载体测序结果、质粒、甘油菌
样本要求待沉默的目的基因需在NCBI上能查到该物种所有转录组信息,否则无法验证设计的siRNA是否会沉默其它基因。
如果需要在特定细胞中进行实验,客户提供生长状况良好的细胞株,同时提供细胞特性,培养条件及相关注意事项。
本公司常备DMEM(H)和RPMI-1640培养基,如细胞需要用其它培养基,则需要客户提供培养基。
需保证目的基因在该细胞中高表达,否则无法进行siRNA筛选验证实验。
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