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甲基化检测(MSP/BSP/qMSP/HRM)

发布时间:2021/09/24
甲基化检测(MSP/BSP/qMSP/HRM)

  实验介绍DNA甲基化在人的正常发育、X染色体失活、衰老以及许多人类疾病(如发育畸形、癌症、心血管疾病、糖尿病和神经心理失调等)过程中发挥重要作用,已经成为表观遗传学和表观基因组学的重要研究内容。 DNA甲基化是表观遗传修饰的主要方式,它是由DNA甲基转移酶(DNA methyl-transferase,Dnmt)催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(mC)的一种反应,它并不改变DNA的一级结构,却在细胞的发育、基因的表达、及基因组的稳定性中起着重要的作用。CpG岛的高甲基化是肿瘤中存在的普遍现象,而启动子CpG岛的高甲基化是除突变和缺失外肿瘤中抑癌基因失活的第三种机制。 因此,基因启动子甲基化检测在临床诊断(如甲基化检测与低剂量CT相结合)、药物敏感性检测等方面具有很高的应用价值。

 

  服务项目依据实验目的及用途的不同,本公司可做以下几种服务:

 

  1> MSP:甲基化定性分析

 

  2> qMSP:对于验证的CpG Island,进行稳定的高度定量和灵敏的甲基化检测分析

 

  3> BSP:甲基化克隆测序分析,一般挑选10-15个克隆进行测序分析,一般可以提供≥10个测序结果

 

  4> HRM:高分辨率溶解曲线进行甲基化分析

 

  交付结果:实验报告、返还样本及产物

 

  质量保证:客观、公正、可信数据结果

 

  交付时间:大约10-15个工作日(根据预实验、样本数量情况决定)

 

  服务流程1、 依据客户提供的基因及下游实验,设计合成相应引物

 

  2、 DNA提取与质量分析

 

  3、 亚硫酸盐修饰即CT转换

 

  4、 预实验验证引物,优化PCR条件

 

  5、 MSP:普通PCR产物电泳

 

  qMSP:选择合适的内参及优化后的引物,进行荧光定量PCR

 

  BSP:对普通PCR获得的产物进行纯化,TA克隆,挑选10-15个克隆进行测序,提供≥10个测序成功结果

 

  HRM:选择优化后的引物,进行荧光定量PCR

 

  6、对实验结果进行分析,撰写详细实验报告,包括引物序列,包括DNA提取方法、DNA电泳图、普通PCR电泳图、qPCR扩增曲线、溶解曲线、院士程序、菌液PCR电泳图、测序原始文件及测序结果分析,以及最终的甲基化程序分析。

 

  样本要求可用于提取基因组的实验材料,如细胞(≥105个)、组织(≥50mg)

 

  实验周期:10-15个工作日(根据预实验、样本数量、基因情况决定)

 

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