基因富集结果模块聚类和筛选关键基因
发布时间:2021/09/24
实验介绍对基因集进行富集分析时,常会得到很多富集条目,过多的富集结果不容易展示和解释。基于FGNet包,我们开发此模块,旨在将基因注释到相似功能条目上(如GO,kegg),对功能条目进行聚类划分,分析聚类之间的相似性,以及关键基因。便于从多个富集结果中分析出重要基因。
2.流程图
3结果展示
图1 FGNet分析功能网络图。左图表示将基因注释到不同功能模块中,白色节点是连接功能模块之间的重要预测节点,Mg表示模块,每个模块包括GO term和KEGG pathway;右图展示了通过多功能基因连接模块的总体分布图。
图2 功能模块之间的层次聚类结果,color bar表示distance,由该图可以看出不同模块之间的距离,距离越大,表示相似性越小