基于NetBox的蛋白质互作网络构建

　　实验介绍NetBox是基于Java的开发的一款软件工具，可用于执行人类蛋白互作网络的分析。该工具基于人类互作网络（human interaction network，HIN），该网络由四个数据源组成，HPRD， Reactome, NCI-Nature PID数据库，以及MSKCC Cancer Cell Map. 自动将基因连接成网络，并识别显著的“linker”基因，同时将网络划分成模块。结果以HTML、TXT形式展示，可以加载到Cytoscape中进行可视化以及后续分析。

 

　　流程图

 

　　3.结果展示

 

　　图1  NetBox分析结果网页报告

 

　　图2 NetBox分析得到的由“linker”基因连接的模块。菱形代表“linker”基因，圆形表示分析得到的差异基因