微生物基因组Denovo测序分析

　　实验介绍微生物基因组De novo测序分析也叫微生物基因组从头测序分析，指不依赖于任何参考序列信息就可对某个微生物进行分析的测序分析技术，用生物信息学的方法进行序列拼接获得该物种的基因组序列图谱，然后进行注释等后续一系列的分析。微生物Denovo基因组测序及分析技术可以应用于医药卫生等领域。

 

　　技术应用领域

 

　　基因组图谱的系统性构建

 

　　微生物致病性和耐药性位点检测及相关基因功能研究

 

　　微生物的比较基因组分析，确定各个近缘微生物中的系统发育关系

 

　　服务流程:基本分析流程图

 

　　可能的结果展示图

 

　　示例图1 微生物基因组的功能注释[1]

 

　　示例图2 微生物基因组的系统进化关系[1]

 

　　参考文献示例图参考文献[1] Van den Bogert B1, Boekhorst J2, Herrmann R1, Smid EJ3, Zoetendal EG1, Kleerebezem M4. Comparative genomics analysis of Streptococcus isolates from the human small intestine reveals their adaptation to a highly dynamic ecosystem. PLoS One. 2013 Dec 30;8(12):e83418.