小RNA测序数据
发布时间:2021/09/24
实验介绍Small RNA是一类重要的体内调节分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。可参与基因转录后调控,调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程。Small RNA测序是研究生物样品小RNA的最主要方法之一,首先采用胶分离技术,收集样品中18-30nt的RNA片段;再利用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息。
应用
1. 观察疾病发生过程中病灶部位内部miRNA的表达异常,确定与疾病相关miRNA
2. 基于小RNA样本的新miRNA预测和新miRNA的调控靶基因预测
服务流程:
数据处理和分析流程图
示例1 A图为测序序列分类,B图为每个类别中序列长度分布,C图为miRNA表达水平聚类
示例2 miRNA、靶基因与miRNA上游TF网络图
示例3 miRNA预测结果示意图