miRNA靶基因分析

　　实验介绍miRNA是一类广泛存在于真核生物中的非编码RNA，成熟的miRNA的长度在22nt左右，在转录后水平上通过调节其靶基因行使功能。miRNA已经被证明与多种癌症相关基因的表达有关。因此，识别miRNA的靶基因对于认识基因之间的网络调控关系，以及人类疾病的防治和治疗都有着非常重要的关系。

 

　　分析内容：我们可以把分析分成两种类型： 1）预测集：收集多个数据库关系对数据（例如：miRanda、MirTarget2、PicTar、PITA等），使用多个工具预测miRNA-mRNA关系对；2） 验证集：收集实验验证的数据库，输出为经过试验验证的miRNA-mRNA关系对。 提供的内容既可以是感兴趣的miRNA，也可以是感兴趣的genes. 结果提供关系对数据以及网络图。

 

　　图1 miRNA-target网络。A是上调基因的miRNA靶基因网络；B是下调基因的miRNA靶基因网络