基于转录组的进化分析

　　实验介绍基于转录组数据进行进化分析核心原理就是构建直系同源基因簇，获得进化分析的super matrix。

 

　　方法目前来说有两种，基于super matrix和super tree。

 

　　基于super matrix的方法也就是在基于barcode的进化分析流程中给出的方法，也是基于数目不多的多个基因构建进化树的常用方法，对不同的直系同源基因簇分别在物种间比对后序列串联起来，在根据这个super matrix（这里的matrix指序列）构建进化树。

 

　　而基于super tree的方法构建进化树则与前面流程图所示相似，先对不同直系同源基因簇分别多序列比对，然后分别构建进化树，再将不同基因簇构建的进化树整合在一起形成物种树。不论是super matrix 或者super tree构建的进化树，都充分利用了基因组上的遗传信息，相比于单个或少数几个基因构建进化树来讲，更符合构建进化树的模型，碱基的使用偏倚、密码子使用偏好、位点间差异率等更倾向于真实的进化模型。在计算条件允许的情况下，利用最多的同源基因簇基因构建的进化树更符合真实的进化历程。

 

　　可研生物科技有限公司为客户提供快速的转录组的进化分析，并提供后续个性化分析，一对一沟通项目问题。

 

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