DNA甲基化之MeDIP-Seq

　　实验介绍MeDIP-Seq 全称Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing，即甲基化DNA免疫共沉淀测序。该种测序方法通过使用5'-甲基胞嘧啶抗体特异性抓去样本中甲基化程度高的DNA片段，并对富集的DNA片段进行高通量测序。相对于BS-seq和RRBS-seq技术而言，MeDIP-seq技术以较小的数据量和较高的性价比，帮助科研人员检测基因组上的甲基化区域。

 

　　需要注意的是，MeDIP-seq生成DNA甲基化图谱最小分辨率在50-100bp左右，无法达到BS-seq和RRBS-seq的单碱基分辨率。

 

　　应用

 

　　1、处于特定时期或特定处理条件下的样本中，研究样本中染色体DNA甲基化模式；

 

　　2、比较不同细胞、组织、样本间的DNA甲基化修饰模式的差异。

 

　　3、疾病样本中，与疾病发生发展相关的DNA甲基化表观遗传机理研究和相关DNA甲基化分子标志物的探索性研究。

 

　　我们能提供详尽的全基因组重测序数据的处理和分析服务。

 

　　如您没有标准化的数据、只需流程中的局部分析内容或要求特立独行的数据分析思路，我们亦能满足您的要求。

 

　　服务流程:数据处理和分析流程图

　　示例图片展示

　　示例图1. DNA甲基化信号在不同类型染色体区域的分布

　　示例图2. 特定基因区域内甲基化信号展示[1]

 

　　示例图3. 基因TSS位点周围甲基化信号分布特征分类[1]

 

　　参考文献[1].Kim, J.H., et al., Deep sequencing reveals distinct patterns of DNA methylation in prostate cancer. Genome Res, 2011. 21(7): p. 1028-41.