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蛋白质组芯片

发布时间:2021/09/24
蛋白质组芯片

  实验介绍蛋白质组芯片是一种高通量的蛋白功能分析技术,可用于蛋白质表达谱分析,研究蛋白质与蛋白质的相互作用,甚至DNA-蛋白质、RNA-蛋白质的相互作用,筛选药物作用的蛋白靶点等。

 

  应用蛋白质组芯片可以进行基因表达的筛选、抗原抗体检测、蛋白筛选、生化反应检测、药物筛选以及疾病诊断等,相比于质谱的昂贵报价以及数据量来说,蛋白质组芯片的优势更加明显。

 

  可研生物科技有限公司推出自主知识产权的蛋白质芯片标准分析流程,可以快读准确的读取蛋白质组芯片并进行标准分析,精准的获得芯片检测结果,同时提供个性化下游分析策略。

 

  服务流程:

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  常规分析流程:

 

  1. 芯片预处理,样本peak双向聚类

 

  2. 过滤分析,PCA分析,发现离群样本,PCA分析是一种降维技术,可以将多维(即蛋白peak数)的芯片数据投射到低维空间中。相似的样本所在的点将彼此靠近,可以通过PCA分析找到那些“离群”的样本。

 

  3. 分组差异peak的筛选,根据实验样本的分组情况进行差异峰的筛选,并进行聚类分析,确定差异峰(蛋白)及不同样本之间的互作关系。一般认为在聚类图上距离越近的样本或差异峰之间的关系越密切。

 

  4. 疾病预测模型的构建,利用决策树,神经网络,SVM等机器学习方法来建立了分组诊断的模型,目的在于利用实验数据来筛选出一批靶标peak,并以此构建模型,以进行早期诊断、疾病预测和预后分析。

 

  5. peak注释。功能分析,从基因水平上研究差异peak的功能信息,从不能的处理实验对比发现疾病的分子机制。

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